Свою историю в России Церковь ведет, начиная с 1843 г., когда Джозеф Смит направил в Российскую Империю двух миссионеров - Орсона Хайда и Джорджа Дж. Адамса. Однако гибель самого Джозефа Смита оборвала эту миссию. В 1857 г. Бригам Янг хотел послать миссионеров на острова Японии, а также в Сибирь, но из-за войны в штате Юта эта миссия также не состоялась. Однако в том же 1857 г., во время своего служения в Турции, Джейкоб Спори сообщил о том, что крестил нескольких русских.
В 1895 г. в г. Санкт-Петербург был послан миссионер, Август Джоэл Хоглунд. 11 июня 1895 г. он крестил в р. Неве двух первых членов Церкви в России Йохана и Алму Августу Линдлофов, семью эмигрантов из Финляндии, жившую в Санкт-Петербурге. Это были первые крещения в России. В 1903 году Линдлофов посетил Апостол Фрэнсис М. Лайман, президент Европейской миссии, который приехал в Россию с тем, чтобы освятить ее для миссионерской работы. Примерно в то же время, в 1900 г., в Кенигсберге (Калининграде) был сформирован приход.
Фрэнсис М. Лайман, член Кворума Двенадцати Апостолов, был призван координировать работу всех миссий Европы в качестве президента Европейской миссии. В 1901 г. он приехал в Ливерпуль (Англия) и вскоре начал рассматривать возможности учреждения Церкви в России. Приезду Лаймана в Россию предшествовало важное событие, произошедшее 13 марта 1903 года - указ императора Николая II о свободе вероисповеданий на территории Российской империи. 6 августа 1903 г. в Санкт-Петербурге Лайман произнес молитву освящения. Молитва была произнесена в Летнем саду, в восточной части центрального района Санкт-Петербурга. Спустя три дня Лайман посетил Москву, и у Кремлевской стены снова, во второй раз, молился о том, чтобы в России могла начаться миссионерская работа. До 1917 г. Санкт-Петербург и другие крупные города России посещали представители Церкви Иисуса Христа Святых последних дней. Революционные события в России и установление советской власти прервали миссионерскую деятельность почти на 90 лет, хотя еще 27 апреля 1919 г. Эндрю Хасберг, представитель экспедиционных войск США, был крещен в озере недалеко от Владивостока, и это было первое крещение на Дальнем Востоке.
В 1959 году старейшина Эзра Тафт Бенсон, член Кворума Двенадцати Апостолов, служивший тогда министром сельского хозяйства Соединенных Штатов Америки, посетил в Москве Центральную Баптистскую церковь и выступил там с проповедью. В 1989 году миссионеры снова прибыли в Санкт Петербург, а 3 февраля 1990 года в Санкт-Петербурге стоялось первое крещение. В 1991 году широкую известность приобрел Табернакальный хор, выступивший в Москве в Большом театре и в Ленинграде.
28 мая 1991 г. Церковь Иисуса Христа Святых последних дней была официально признана в России.
14 мая 1998 г., в соответствии с новым Федеральным Законом Российской Федерации "О свободе совести и религиозных объединениях" Церковь Иисуса Христа Святых последних дней была перерегистрирована и получила статус централизованной религиозной организации "Религиозная Ассоциация Церкви Иисуса Христа Святых последних дней". Представительства централизованной религиозной организации действуют в городах Владивосток, Новосибирск, Екатеринбург, Самара, Ростов, Санкт Петербург. В состав централизованной религиозной организации входит 47 местных религиозных организаций зарегистрированных в соответствии с законом РФ, объединяющих более 19 тысяч верующих во многих городах России.